Unité de Technologies Moléculaires Appliquées (LTMA)

Prof Jean-Luc GALA

Site Web: http://www.ltma.be/index.php

Implication dans le Programme NANOTIC:

• Projet DEDICCAS: Prof. Jean-Luc GALA

Autres Partenaires NANOTIC

Le Prof Jean-Luc Gala a développé et mené à bien plusieurs projets novateurs dans le domaine de la génomique au sein de l’unité « Technologies Moléculaires Appliquées » ou « LTMA ». L’équipe de recherche déploie une intense activité de recherche de translationnelle dont la finalité est le développement et l’utilisation clinique de la génomique à des fins diagnostiques ou pronostiques.

Le laboratoire est donc tout particulièrement actif dans le domaine  de la génomique du cancer  et dans le domaine de la pharmacogénétique. Ils ont également conduit à la mise au point de kit diagnostiques et ont contribué à l’élaboration et au design des microdamiers produits par Eppendorf Array Technologies (cf collaborations scientifiques).

Les technologies utilisées combinent les méthodes classiques de la biologie moléculaire incluant l’amplification, l’amplification en temps réel, les méthodes de clonage et de séquençage (classique ou pyroséquençage), l’évaluation fonctionnelle d’altérations géniques au moyen de levures génétiquement modifiées ; et le développement de méthodologies nouvelles parmi lesquelles la technologie des Projet DEDDICAS microdamiers ARN ou ADN de basse densité (développement issu d’une collaboration avec Eppendorf Array Technologies [EAT]) et de biopuce haute densité (Affimetrix).
Ce type d’expertise nécessite également l’acquisition et la maîtrise des programmes d’analyse d’image et de quantification des données fournies par les biopuces, et l’établissement d’une véritable plate-forme incluant les lecteurs de colorimétrie et de fluorescence laser. A ceci s’ajoute le développement des méthodes de microdissection tumorale par laser, méthodes complémentaires à la technologie des microdamiers et qui sont essentielles pour l’évaluation de tumeurs de composition hétérogène.  Depuis 2002, l’unité LTMA a également constitué plusieurs banques d’ADN et d’ARN à partir de prélèvements sanguins ou tissulaires adressé au laboratoire pour analyse moléculaire ou génétique, notamment les tumeurs de la sphère urologique ou les tumeurs de la sphère tête-et-cou.

Dans le cadre de partenariat de recherche, elle utilise les banques de sera collectés dans le cadre de maladies inflammatoires auto-immunitaires. Pour des raisons de confidentialité, cette banque reprend uniquement les données administratives essentielles des patients (nom, prénom, date de naissance, sexe). Les données cliniques sont, quant à elles, consignées au service central des archives et disponibles pour des études génétiques ponctuelles moyennant accord préalable du comité d’éthique des Cliniques universitaires St Luc. Cet outil extrêmement précieux a déjà permis et permet de valider rapidement de nouvelles applications pronostiques ou diagnostiques.

LTMA est aussi très actif dans le domaine de la génétique moléculaire bactérienne. Ces travaux de génétique moléculaire ont permis le dépôt de 4 brevets nationaux ou internationaux dont le Prof Gala est le détenteur.  Dans le cadre d’un précédent projet Waleo (TMADNAPN #11/4853), nous avons développé et breveté une méthode de diagnostic différentiel spécifique plus large, englobant la plupart des bactéries gram-positive et gram-négative (PCT/EP2005/002927). Cette découverte a permis à LTMA d’être admis comme investigateur dans le groupe européen  WEAG/CEPA13 (bientôt repris au sein de l’Agence européenne de l’Armement (EDA), ainsi que dans le réseau COST B28 (Array technologies for BLS3 and BSL4 pathogens), Le Prof Gala étant officiellement désigné comme l’un des deux représentants belges de ce groupe.

Au cours de ces années, l’unité LTMA a établi une véritable banque de souches cliniques et de souches de référence par contact et échange avec plusieurs laboratoires universitaires ou hospitaliers belges et étrangers ainsi que par achat auprès de banques officielles (American Type Culture Collection [ATCC]; Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [DSMZ]). Des contacts bilatéraux de collaboration existent par ailleurs avec l’Institut Scientifique de la Santé Publique – Louis Pasteur, les laboratoires de Biologie Moléculaire Infectieuse la Bundeswehr à Munich.

En 2005, le Prof Gala et la Prof B. Macq ont initié ensemble le lancement du projet First Spin Off « THEDIBAC », soutenu par la Région wallonne. L’objectif de ce projet est de développer une politique de recherche translationnelle avec implémentation et accréditation d’analyses développées dans les laboratoires de recherche. 

Equipements

• Un équipement de pointe pour les technologies moléculaires : 13 thermocycleurs, 1 matériel de PCR en temps réel (ABI PRISM 7700) , un séquenceur capillaire (ABI 3100), 1 pyro-séquenceur Isogen PSQ96, … ;
• L’équipement nécessaire à l’utilisation des biopuces : scanneur avec caméra à transfert de charge (imageur CCD) pour la détection de la fluorescence (Scanner Array Worx, Applied  Precision), un lecteur colorimétrique basé sur la réflexion de la lumière, 2 fours à hybridation Techne HB-1D ;
• Un microscope inversé à fluorescence type Axiovert 40 (Carl Zeiss) pour la détection de clone EGFP recombinant.
• Trois locaux P2 bactériens et un P2 eucaryotes ; un laboratoire de type P3.